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熟悉的肿瘤免疫微环境分析,深入探究乳腺癌亚型的免疫差异

为了确认集群与肿瘤免疫微环境相关（图1b），使用算法Nanodissect为总淋巴细胞和骨髓细胞浸润打分。Nanodissect评分首先在MicMa队列中使用有经验的病理学家分析的匹配苏木精和曙红切片的免疫浸润评估进行验证（图1c和补充图1E）。发现这三个簇与Nanodissect淋巴细胞（图1b）和骨髓细胞（补充图1F）评分显著相关。

通过单细胞RNA测序（scRNA-seq），研究者能够揭示乳腺癌中免疫细胞图谱的异质性。在TNBC、HER2+和管腔样乳腺癌中，研究发现了不同的免疫细胞群比例和转录组特征，尤其是B细胞在TNBC中的显著富集。此外，T细胞介导的免疫抑制环境在TNBC中更为明显，而浆细胞的富集现象也表明了TNBC中独特的免疫微环境。

MIRS-high亚型在转移信号和免疫浸润方面与MIRS-low亚型存在显著差异。研究还分析了MIRS与化疗之间的相关性，发现化疗可能对MIRS-high亚型更有利。在乳腺癌诊疗过程中，人工智能的应用为降低乳腺癌发病率和死亡率提供了可能。

此疗法阶段中医药手段也不能完全解决肿瘤，但是众多研究表明之一时间应用中医药，特别是对症应用，对肿瘤的预后和生存期延长非常有好处，此处所说中医药包括口服、外用等各种剂型。

ki-67指数为10%。这一数值表明肿瘤细胞的增殖活性较低。 CK5/6结果为阴性。这通常意味着肿瘤细胞来源于腺上皮。 EGFR结果为阴性。这可能意味着缺乏相应靶点，但有人认为免疫组化结果不能完全替代基因检测。 P53结果为阳性（+20%）。

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chedoir是什么牌子

1、克里斯汀·迪奥（Christian Dior），简称Dior，是法国的时尚品牌。 该品牌由时装设计师克里斯汀·迪奥创立，总部位于巴黎。 Dior公司主要产品包括男女手袋、时装、鞋履、首饰、香水、化妆品以及童装等高端消费品。

2、是克里斯汀，迪奥（Christian，Dior，简称Dior），是法国时尚消费品牌。迪奥公司由法国时装设计师克里斯汀，迪奥创立，总部设在巴黎。主要经营男女手袋、女装、男装、男女鞋履、首饰、香水、化妆品、童装等高档消费品。

品牌有哪些

1、路易威登 作为全球知名的奢侈品牌，路易威登以其独特的设计和高品质的手提包、服装、鞋履和配饰著称。 香奈儿 香奈儿是一个历史悠久的时尚品牌，以其经典的小黑裙、高级时装和香水闻名于世。 劳力士 劳力士是全球最知名的腕表品牌之一，以其精湛的工艺和卓越的性能受到全球消费者的青睐。

2、国际知名品牌：路易威登、古驰、迪奥、香奈儿、爱马仕、普拉达、阿玛尼、杰尼亚等。国内知名品牌：安踏体育、华为、李宁、海澜之家、太平鸟等。这些品牌在国内拥有广泛的知名度和市场份额。安踏体育和华为不仅在服装领域表现出色，还涉及科技等其他领域。

3、路易威登、古驰、迪奥、香奈儿、爱马仕等。这些品牌以其卓越的设计、精湛的工艺和高端的品质，成为时尚领域的佼佼者。它们的产品涵盖了服装、鞋履、箱包、配饰等多个领域，深受全球消费者的喜爱。汽车领域 奔驰、宝马、奥迪、丰田、大众等。

openalex文献开放数据库(附R语言访问 *** )

1、openalex是一个开放的学术资源索引，提供免费数据集，包括论文、作者、机构、概念、出版物等实体结构。访问该数据库非常方便，通过API或R语言中的openalexR包进行检索。只要知道作者的ORCID、论文的DOI或其他信息，即可进行相关查找。在R语言环境中使用openalexR包，操作十分便捷。

【必学Bioconductor包300个】IRanges

1、IRanges 用来处理IRanges数据实例。

2、因为是向量，因此IRanges只有一个维度，不能使用dim（） *** ，但是我们可以使用length（）获取其长度。我们可以像操作向量一样，对IRanges对象进行操作，如 甚至可以利用c（）将两个IRanges对象合并 有时候在阅读R包的资料时，你也许会看到NormalIRanges对象，它是由使用reduce函数对IRanges对象处理得到。

免疫浸润分析 ***

目前常用的免疫浸润分析 *** 有CIBERSORT、ssGSEA、Xcell、MCPcounter、immundeconv等。下面以CIBERSORT和ssGSEA为例进行详细解析。CIBERSORT分析CIBERSORT基于线性支持向量回归进行反卷积分析。主要需要准备两个文件：表达矩阵文件和参考数据集文件。其中，表达矩阵文件包含基因符号和样本ID；参考数据集文件用于比较分析。

实战应用xCell现在，让我们一起学习如何使用xCell进行基因表达数据的免疫浸润分析。

以ssGSEA为例，它是单样本基因集富集分析，最初在2009年提出，适合于处理单个样本数据。R包GSVA常用于执行ssGSEA，尤其是在评估免疫细胞浸润方面。免疫浸润的量化分析 *** 还包括immunedeconv，这个R包包含了多种免疫细胞浸润分析工具，如quantiseq、timer、cibersort等。

接下来，寻找表型，我们通过免疫相关基因数据库（如IMMPORT）和在线工具（如TIMER2）来分析基因对免疫细胞浸润的影响。选择特定免疫细胞进行分析，以便发现基因如何影响患者生存。通过这种 *** ，我们以OXTR为例，发现其对间皮瘤患者MDSC浸润有显著影响。

糖尿病视网膜病变的免疫细胞浸润情况则通过CIBERSORT算法分析，结合加权基因共表达 *** 分析和差异表达分析，识别可能影响DR进展的hub基因。这些分析 *** 并不复杂，易于复现，主要特点是分析了免疫细胞的浸润情况。

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